La Società dell'Apostolato Cattolico, come Società di vita apostolica, ha una struttura gerarchica a tre livelli. Il supremo organo amministrativo è il Regime Generale con sede a Roma.

Il secondo livello organizzativo è formato dalle Province e dalle Regioni. Esse sono unità organizzative indipendenti con un certo numero di membri. I Regimi Provinciali o Regionali coordinano le attività delle relative entità, prendono decisioni personali e provvedono alla vita spirituale e comunitaria dei membri. I superiori di esse si chiamano Rettore Provinciale o Rettore Regionale. La Società è suddivisa in 12 Province e 8 Regioni. Ognuna di loro ha un proprio nome, che determina nello stesso tempo la sua festa titolare o patronale.

Al terzo livello di organizzazione si trovano le Comunità Locali, in cui vivono e lavorano i Pallottini. In tutto il mondo esistono oltre 300 Comunità Locali canonicamente erette. Alcune di esse sono piccole e consistono solo di tre o quattro membri, altre (p.es. le case di formazione, i seminari maggiori) ne hanno un numero più grande.